A templomot még 1912-ben felújították, ekkor nyitották egybe a loretói kápolnát a felsőtemplommal. Önálló plébániaként huszonnégy évvel ezután kezdett el működni. A templom közelében épült a Salvator Nõvérek zárdája, de 1950-ben a kapucinusoknak és a Salvator Nővéreknek is el kellett hagyniuk Máriabesnyőt a szerzetesrendek feloszlatása okán.

Az épület egyes részeit az Agrártudományi Egyetem, majd a Török Ignác Gimnázium (TIG) használta. Az épületek 1989 augusztusában kerültek vissza egyházi tulajdonba, ekkor ismét felújították.

A kegytemplom kilenc évvel ezelőtt, 2008-ban kis bazilika rangot kapott. E cím alapján teljes búcsú nyerhető a Bazilikában: a bazilika felszentelésének évfordulóján, Szent Péter és Pál apostolok főünnepén, a bazilika cím megadásának évfordulóján, évente egy olyan napon, amelyet a Kegyszobor megtalálásának napja, és évente egy olyan napon, amelyet minden hívő szabadon választ meg.